某些代謝物被 KEGG 網(wǎng)站收錄了,所以有相應(yīng)的編號。但在收錄的信息里沒有參與通路,所以沒有相應(yīng)的通路信息。蛋白組學(xué)里也存在類似的情況。


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差異代謝物可以查 CO/KO 號,但在通路圖中沒有找到對應(yīng)的通路,為什么?
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如果靶向檢測過程中,有物質(zhì)RSD>30%,說明什么?
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血液樣本做代謝組學(xué)分析,血清樣本和血漿樣本哪一個比較好?
血清血漿都是血液樣本處理后得到的樣品,現(xiàn)有文獻(xiàn)報道血清血漿中代謝物種類及豐度確實不同,但對于研究而言,并沒有明確表明哪種樣本類型優(yōu)于另一種,所以在選擇血清or血漿時,只要在收樣時保證統(tǒng)一即可,且血液樣本最好是選擇EDTA或肝素抗凝的血漿比較好。收集過程需要避免溶血,樣收集后應(yīng)保存在-80℃條件下,并且避免反復(fù)凍融
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非靶向代謝組能得到代謝物的實際濃度嗎?
不能,非靶得到的是代謝物的相對豐度,不是代謝物的實際含量
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當(dāng)正負(fù)離子模式下都檢測到了某種物質(zhì),如何對該物質(zhì)的結(jié)果進(jìn)行呈現(xiàn)?
會根據(jù)匹配參數(shù)進(jìn)行取舍,選用匹配參數(shù)更好的模式下的數(shù)據(jù)在二級結(jié)果中進(jìn)行分析。