服務簡介
DIA(Data-independent acquisition,數據非依賴性采集)技術是蘇黎世聯邦理工學院的Ruedi Aebersold團隊研發的一項全新的質譜采集模式技術(也稱為SWATH),基于此技術衍生出的蛋白組學簡稱為DIA蛋白組。數據非依賴性掃描模式是將質譜整個全掃描范圍分為若干個小窗口,依次對每個窗口的所有離子進行碎裂,使其能夠對掃描區間內的所有肽段離子進行高速一級MS掃描再進行二級MS/MS分析,從而降低樣本檢測的缺失值,同時提高定量準確性和重復性,實現大樣本隊列中高穩定,高精準的蛋白質組定量分析。 三黍生物采用Thermo公司 Orbitrap Exploris 480高分辨質譜系統,,集質譜系統的高分辨、準確質量數穩定性、高靈敏度和高速度掃描特點于一身,推出DIA定量蛋白組分析服務。
應用領域
植物生長發育機制研究
植物逆境脅迫機制研究
植物轉錄調控研究
技術路線


研磨稱量


蛋白抽提


酶解純化


上機測試


搜庫對比


數據分析


報告出具
技術優勢
全掃描:采集所有的離子信息,包括低豐度蛋白和肽段
超高定量準確度高:定量準確性接近SRM/MRM靶向技術
高通量:缺省值CV低,有效蛋白數據量更高
可溯源:不同批次數據整合分析和回溯性
樣本要求
1、樣品類型
植物組織;微生物(細菌或真菌);液體類(根系分泌液等);
2、生物學重復
建議3次及以上生物學重復;
3、樣品需求量
植物組織≥200mg;微生物(細菌或真菌)≥200mg;液體類≥2.5ml;特殊情況請與公司聯系;
4、樣品準備
樣本準備基本原則有:代表性原則;迅速性原則;分裝備份原則;污染控制原則;低溫原則。公司可提供詳細的樣本準備和運輸指南;
5、保存和運輸
樣本用液氮速凍,-80度保存或者直接干冰寄送即可;
6、樣品標記要求
樣品標記清晰,盡量使用英文和數字組合,字符數在15個以內為好。同時按照公司的技術需求表填寫樣本詳細信息;
7、其他
客戶認真填寫公司的技術需求表,務必隨樣品一起郵寄,由于表格信息不全造成的損失由客戶自行承擔。
結果示例
部分分析結果
參考文獻
1) Advancing Urinary Protein Biomarker Discovery by Data-independent Acquisition on a Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer.
2) Multi-laboratory assessment of reproducibility, qualitative and quantitative performance of SWATH-mass spectrometry.
3) Data-Independent Acquisition-Based Proteome and Phosphoproteome Profiling Reveals Early Protein Phosphorylation and Dephosphorylation Events in Seedlings upon Cold Exposure.