服務簡介
植物基因組De novo測序分析也叫從頭測序分析，指不依賴于任何參考序列信息就可對某動植物進行測序分析，使用最新的生物信息學方法進行序列拼接獲得某物種的基因組序列圖譜，并進行基因組結構注釋、功能注釋、比較基因組學分析等一系列的后續分析。基因組測序不僅可以獲得該物種的全基因組序列圖譜，同時也為后續物種起源進化及特定環境適應性的研究奠定了基礎。三代測序技術（以PacBio和Nanopore為代表）具有讀長長的特點，近幾年在動植物基因組De novo中初露鋒芒，已延用至今。該類型測序分析結果可以廣泛應用于農林魚牧醫藥及海洋等各個方面的研究。
應用領域
全基因組范圍內多性狀定位
品質形成分子機制研究
新物種、品種基因組測序
技術路線
研磨稱量
代謝物抽提
文庫構建
上機測序
數據解析
報告出具
技術優勢
設備先進，三代測序平臺（PacBio/Nanopore測序平臺）
技術先進，Hi-C染色質構象捕獲技術
樣本要求
1、樣品類型
植物組織；細胞；微生物（細菌或真菌）；
2、生物學重復
一般單次重復；
3、樣品需求量
植物組織≥500mg；微生物（細菌/真菌）≥500mg；
4、樣品準備
樣本準備基本原則有：代表性 原則；迅速性原則；分裝備份原則；污染控制原則；低溫原則。公司可提供詳細的樣本準備和運輸指南；
5、保存和運輸
樣本用液氮速凍，-80度保存或者直接干冰寄送即可；
6、樣品標記要求
樣品標記清晰，盡量使用英文和數字組合，字符數在15個以內為好。同時按照公司的技術需求表填寫樣本詳細信息；
7、其他
客戶認真填寫公司的技術需求表，表格信息不全會對后期項目進行產生諸多影響，請填寫后務必隨樣品一起郵寄。
結果示例
部分分析結果示例
參考文獻
1) Genome-Wide Population Structure Analyses of Three Minor Millets: Kodo Millet, Little Millet, and Proso Millet.
2) Genome-wide association study reveals new genes involved in leaf trichome formation in polyploid oilseed rape (Brassica napus L.).
3) Genome-Wide Association Study of a Worldwide Collection of Wheat Genotypes Reveals Novel Quantitative Trait Loci for Leaf Rust Resistance.
4) Whole-genome sequencing of the snub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history.