農(nóng)學(xué)服務(wù)
基于高精密儀器量化生命，基于大數(shù)據(jù)分析解析生命。十年技術(shù)沉淀，專業(yè)的設(shè)備和技術(shù)支持，為農(nóng)業(yè)、植物、食品和環(huán)境領(lǐng)域技術(shù)開發(fā)、科學(xué)研究提供完整的技術(shù)解決方案和專業(yè)的分析檢測服務(wù)。創(chuàng)新一站式技術(shù)解決方案，努力成為廣大科研從業(yè)者最專業(yè)的技術(shù)合作伙伴。
服務(wù)簡介
植物基因組De novo測序分析也叫從頭測序分析，指不依賴于任何參考序列信息就可對某動植物進(jìn)行測序分析，使用最新的生物信息學(xué)方法進(jìn)行序列拼接獲得某物種的基因組序列圖譜，并進(jìn)行基因組結(jié)構(gòu)注釋、功能注釋、比較基因組學(xué)分析等一系列的后續(xù)分析。基因組測序不僅可以獲得該物種的全基因組序列圖譜，同時(shí)也為后續(xù)物種起源進(jìn)化及特定環(huán)境適應(yīng)性的研究奠定了基礎(chǔ)。三代測序技術(shù)（以PacBio和Nanopore為代表）具有讀長長的特點(diǎn)，近幾年在動植物基因組De novo中初露鋒芒，已延用至今。該類型測序分析結(jié)果可以廣泛應(yīng)用于農(nóng)林魚牧醫(yī)藥及海洋等各個(gè)方面的研究。
應(yīng)用領(lǐng)域
全基因組范圍內(nèi)多性狀定位
品質(zhì)形成分子機(jī)制研究
新物種、品種基因組測序
技術(shù)路線
研磨稱量
代謝物抽提
文庫構(gòu)建
上機(jī)測序
數(shù)據(jù)解析
報(bào)告出具
技術(shù)優(yōu)勢
設(shè)備先進(jìn)，三代測序平臺（PacBio/Nanopore測序平臺）
技術(shù)先進(jìn)，Hi-C染色質(zhì)構(gòu)象捕獲技術(shù)
樣本要求
1、樣品類型
植物組織；細(xì)胞；微生物（細(xì)菌或真菌）；
2、生物學(xué)重復(fù)
一般單次重復(fù)；
3、樣品需求量
植物組織≥500mg；微生物（細(xì)菌/真菌）≥500mg；
4、樣品準(zhǔn)備
樣本準(zhǔn)備基本原則有：代表性 原則；迅速性原則；分裝備份原則；污染控制原則；低溫原則。公司可提供詳細(xì)的樣本準(zhǔn)備和運(yùn)輸指南；
5、保存和運(yùn)輸
樣本用液氮速凍，-80度保存或者直接干冰寄送即可；
6、樣品標(biāo)記要求
樣品標(biāo)記清晰，盡量使用英文和數(shù)字組合，字符數(shù)在15個(gè)以內(nèi)為好。同時(shí)按照公司的技術(shù)需求表填寫樣本詳細(xì)信息；
7、其他
客戶認(rèn)真填寫公司的技術(shù)需求表，表格信息不全會對后期項(xiàng)目進(jìn)行產(chǎn)生諸多影響，請?zhí)顚懞髣?wù)必隨樣品一起郵寄。
結(jié)果示例
部分分析結(jié)果示例
參考文獻(xiàn)
1) Genome-Wide Population Structure Analyses of Three Minor Millets: Kodo Millet, Little Millet, and Proso Millet.
2) Genome-wide association study reveals new genes involved in leaf trichome formation in polyploid oilseed rape (Brassica napus L.).
3) Genome-Wide Association Study of a Worldwide Collection of Wheat Genotypes Reveals Novel Quantitative Trait Loci for Leaf Rust Resistance.
4) Whole-genome sequencing of the snub-nosed monkey provides insights into folivory and evolutionary history.