服務簡介
宏基因組學(Metagenomics)是由Handelsman等在1998年提出的,可以把微生物群體的所有基因組當成一個單一的基因組去處理。Kevin等對宏基因組學進行了定義,即“無需對微生物個體進行分離培養,直接應用基因組學技術對自然環境中的微生物群落進行研究”的學科。它規避了對樣品中的微生物進行分離培養,提供了對無法分離培養的微生物進行研究的途徑,避免了實驗過程中由環境改變引起的微生物序列變化所帶來的偏差。利用新一代測序技術(NGS)研究 Metagenomics,能快速準確的得到大量生物數據和豐富的微生物研究信息,從而成為研究微生物多樣性和群落特征的重要手段。
應用領域
環境科學研究
食品科學研究
植物-土壤互作研究
土壤科學研究
技術路線


研磨稱量


RNA抽提


文庫構建


上機測序


數據解析


報告出具
樣本要求
1、樣品類型
土壤;堆肥;環境水樣;發酵液等富含微生物的液體等;
2、生物學重復
建議6次及以上生物學重復;
3、樣品需求量
土壤≥1g;發酵液等≥2ml;具體情況請與公司聯系;
4、樣品準備
樣本準備基本原則有:代表性 原則;迅速性原則;分裝備份原則;污染控制原則;低溫原則。公司可提供詳細的樣本準備和運輸指南;
5、保存和運輸
樣本用液氮速凍,-80度保存或者直接干冰寄送即可;
6、樣品標記要求
樣品標記清晰,盡量使用英文和數字組合,字符數在15個以內為好。同時按照公司的技術需求表填寫樣本詳細信息;
7、其他
客戶認真填寫公司的技術需求表,務必隨樣品一起郵寄,由于表格信息不全造成的損失由客戶自行承擔。
結果示例
部分分析結果
參考文獻
1) Unveiling Endophytic Bacterial Community Structures of Different Rice Cultivars Grown in a Cadmium-Contaminated Paddy Field.
2) Effects of High Forage/Concentrate Diet on Volatile Fatty Acid Production and the Microorganisms Involved in VFA Production in Cow Rumen
3) Microbial co-occurrence complicates associations of gut microbiome with US immigration, dietary intake and obesity.