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醫學服務

基于高精密儀器量化生命,基于大數據分析解析生命。十年技術沉淀,專業的設備和技術支持,為基礎醫學、臨床醫學、中醫藥學等領域技術開發、科學研究提供完整的技術解決方案和專業的分析檢測服務。創新一站式技術解決方案,努力成為廣大科研從業者最專業的技術合作伙伴。

服務簡介

        DIA(Data-independent acquisition,數據非依賴性采集)技術是蘇黎世聯邦理工學院的Ruedi Aebersold團隊研發的一項全新的質譜采集模式技術(也稱為SWATH),基于此技術衍生出的蛋白組學簡稱為DIA蛋白組。數據非依賴性掃描模式是將質譜整個全掃描范圍分為若干個小窗口,依次對每個窗口的所有離子進行碎裂,使其能夠對掃描區間內的所有肽段離子進行高速一級MS掃描再進行二級MS/MS分析,從而降低樣本檢測的缺失值,同時提高定量準確性和重復性,實現大樣本隊列中高穩定,高精準的蛋白質組定量分析。 三黍生物采用Thermo公司 Orbitrap Exploris 480高分辨質譜系統,,集質譜系統的高分辨、準確質量數穩定性、高靈敏度和高速度掃描特點于一身,推出DIA定量蛋白組分析服務。

應用領域

生長發育機制研究

疾病發生機制研究

藥理學機制研究

生物標志物研究

疾病分子分型

技術路線

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研磨稱量

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蛋白抽提

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酶解純化

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上機檢測

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搜庫比對

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數據分析

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出具報告

DIA蛋白組專為大樣本數量分析而設計,技術優勢主要有:

全掃描:采集所有的離子信息,包括低豐度蛋白和肽段

超高定量準確度高:定量準確性接近SRM/MRM靶向技術

高通量:缺省值CV低,有效蛋白數據量更高

可追溯:不同批次數據整合分析和回溯性

樣本要求

1、樣品類型

動物組織;細胞;微生物(細菌/真菌);液體類(血液/尿液/腦脊液/灌洗液/關節液等)。

2、生物學重復

建議3次及以上生物學重復。

3、樣品需求量

動物組織≥200mg;細胞需要≥107;微生物(細菌或真菌)≥200mg;液體類≥5ml;具體情況請于公司聯系。

4、樣品準備

樣本準備基本原則有:代表性原則;迅速性原則;分裝備份原則;污染控制原則;低溫原則。公司可提供詳細的樣本準備和運輸指南。

5、保存和運輸

樣本用液氮速凍,-80度保存或者直接干冰寄送即可。

6、樣品標記要求

樣品標記清晰,盡量使用英文和數字組合,字符數在15個以內為好。同時按照公司的技術需求表填寫樣本詳細信息。

7、其他

客戶認真填寫公司的技術需求表,務必隨樣品一起郵寄,由于表格信息不全造成的損失由客戶自行承擔。

結果示例

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部分分析結果示例

參考文獻

1) Advancing Urinary Protein Biomarker Discovery by Data-independent Acquisition on a Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer.

2) Multi-laboratory assessment of reproducibility, qualitative and quantitative performance of SWATH-mass spectrometry.

3) Exploring the oncoproteomic response of human prostate cancer to therapeutic radiation using data-independent acquisition (DIA) mass spectrometry.

4) Rapid mass spectrometric conversion of tissue biopsy samples into permanent quantitative digital proteome maps.

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