橫線(xiàn)代表這個(gè)組的平均值
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靶向結(jié)果里，代謝物柱狀圖里面有一道橫線(xiàn)，代表什么意思？
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非靶代謝怎么為什么不能做兩組之間的韋恩圖？
因?yàn)榉前写x在搜庫(kù)時(shí)，是所有樣本合并在一起搜庫(kù)，因此如果在A(yíng)樣本中鑒定到了某物質(zhì)，但在B樣本沒(méi)有對(duì)應(yīng)的出峰，會(huì)認(rèn)定這個(gè)物質(zhì)只是在B樣本里含量低而不是沒(méi)有，做韋恩圖是為了區(qū)分共有和特有代謝物。
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客戶(hù)在別的地方測(cè)得非靶數(shù)據(jù)，其中關(guān)注的大部分物質(zhì)在我們公司都沒(méi)有檢測(cè)到，原因是？
1、需要在數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索是否存在客戶(hù)關(guān)注的物質(zhì)，沒(méi)有的話(huà)自然是檢測(cè)不到；2、代謝物在樣本中的含量過(guò)低，沒(méi)有辦法檢測(cè)到；3、非靶代謝的目的是廣泛的去檢測(cè)樣本中的代謝物，可能代謝物提取前處理方法不適應(yīng)于客戶(hù)關(guān)注的物質(zhì)；4、搜庫(kù)過(guò)程中，得分值過(guò)低的物質(zhì)被過(guò)濾掉了；5、不同的檢測(cè)方法、儀器、使用的數(shù)據(jù)庫(kù)都是造成檢測(cè)結(jié)果的差異，屬于正常現(xiàn)象。
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轉(zhuǎn)錄組里面只有FPKM值的PCA圖，圖片較少，有什么解決辦法嗎？
可以走售后做PLADA,OPLSDA分析圖，也可以用TPM值去做PCA,PCOA,OPLSDA,PLSDA圖。
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PPI網(wǎng)絡(luò)互作圖可以把基因ID換成基因名稱(chēng)去作圖嗎？
首先要看總表里面有沒(méi)有基因?qū)?yīng)的基因名稱(chēng)，有的話(huà)就可以做，沒(méi)有就不行。