轉錄組是獲得生物體內基因表達的重要方法，代謝組是生物體表型的基礎和直接體現者。轉錄和代謝組學聯合分析，對來自轉錄組和代謝組分子層次的大量數據進行歸一化處理及統計學分析，建立不同層次分子間數據相關關系；同時結合功能分析、代謝通路富集、分子相互作用等生物功能分析，系統全面地解析生物分子功能和調控機制，最終實現對生物變化大趨勢與方向的綜合了解，進而提出分子生物學變化機制模型，并篩選出重點代謝通路或者基因、代謝產物進行后續深入實驗分析與應用。

1) Integrative analyses of transcriptomics and metabolomics in Raphidocelis subcapitata treated with clarithromycin.

2) Comparative transcriptome and metabolome profiling reveal molecular mechanisms underlying OsDRAP1-mediated salt tolerance in rice.

3) Metabolomic and Transcriptomic Analyses of Anthocyanin Biosynthesis Mechanisms in the Color Mutant Ziziphus jujuba cv. Tailihong