服務簡介
動植物基因組De novo測序分析也叫從頭測序分析,指不依賴于任何參考序列信息就可對某動植物進行測序分析,使用最新的生物信息學方法進行序列拼接獲得某物種的基因組序列圖譜,并進行基因組結構注釋、功能注釋、比較基因組學分析等一系列的后續(xù)分析。基因組測序不僅可以獲得該物種的全基因組序列圖譜,同時也為后續(xù)物種起源進化及特定環(huán)境適應性的研究奠定了基礎。三代測序技術(以PacBio和Nanopore為代表)具有讀長長的特點,近幾年在動植物基因組De novo中初露鋒芒,已延用至今。該類型測序分析結果可以廣泛應用于農(nóng)林魚牧醫(yī)藥及海洋等各個方面的研究。
應用領域
全基因組范圍內多性狀的定位
疾病發(fā)生機制研究
技術路線


研磨稱量


核酸抽提


文庫構建


上機測序


數(shù)據(jù)分析


報告出具
技術優(yōu)勢
三代測序平臺(PacBio/Nanopore測序平臺)
Hi-C染色質構象捕獲技術
專業(yè)的技術服務團隊
樣本要求
1、樣品類型
動物組織;細胞;微生物(細菌或真菌)。
2、生物學重復
一般單次重復。
3、樣品需求量
動物組織≥500mg;細胞≥107;微生物(細菌/真菌)≥500mg。
4、樣品準備
樣本準備基本原則有:代表性 原則;迅速性原則;分裝備份原則;污染控制原則;低溫原則。公司可提供詳細的樣本準備和運輸指南。
5、保存和運輸
樣本用液氮速凍,-80度保存或者直接干冰寄送即可。
6、樣品標記要求
樣品標記清晰,盡量使用英文和數(shù)字組合,字符數(shù)在15個以內為好。同時按照公司的技術需求表填寫樣本詳細信息。
7、其他
客戶認真填寫公司的技術需求表,務必隨樣品一起郵寄,由于表格信息不全造成的損失由客戶自行承擔。
結果示例
部分分析結果示例
參考文獻
1) Novel and extendable genotyping system for human respiratory syncytial virus based on whole-genome sequence analysis.
2) Whole-genome sequencing differentiates relapse from re-infection in TB.
3) Genome Sequencing Identifies a Basis for Everolimus Sensitivity.
4) Large-Scale Whole-Genome Sequencing of Three Diverse Asian Populations in Singapore.