服務簡介
轉錄組是特定物種、組織或細胞類型在某個時期或條件處理下,轉錄的所有 RNA(轉錄本)的集合,包括 mRNA 和非編碼 RNA。目前所說的轉錄組測序,即對所有的 mRNA進行測序分析,是基因結構和功能研究的基礎。基于新一代高通量測序技術的轉錄組測序,已廣泛應用于生物學研究、醫學研究、臨床研究和藥物研發等。利用高通量測序技術全面快速得到已知基因表達豐度變化,新轉錄本和罕見轉錄本發現,同時還可以通過測定的序列信息精確地分析轉錄本的 SNP/InDel(編碼序列單核苷酸多態性/插入缺失)、可變剪接、融合基因等序列及結構變異。另外,通過增加測序數據量,轉錄組測序對于檢測低豐度轉錄本和發現新轉錄本(進而預測新的基因)也具有其獨特的優勢。
轉錄組項目RNA-seq的實驗部分流程主要包括:樣品的質量檢測, 雙鏈cDNA的合成, 轉錄組文庫的構建與質檢, 樣本的上機測序以及生信分析等。
應用領域
生長發育機制研究
疾病發生機制研究
藥理學機制研究
技術路線


研磨稱量


核酸抽提


文庫構建


上機測序


數據分析


報告出具
技術優勢
高通量,覆蓋物種編碼基因70%甚至更高
Illumina Novaseq 6000測序平臺覆蓋更廣泛
專業的技術服務團隊
樣本要求
1、樣品類型
動物組織;細胞;微生物(細菌或真菌);液體類。
2、生物學重復
建議3次及以上生物學重復。
3、樣品需求量
動物組織≥200mg;細胞≥107;微生物(細菌/真菌)≥200mg;液體類≥2.5ml;特殊情況請于公司聯系。
4、樣品準備
樣本準備基本原則有:代表性原則;迅速性原則;分裝備份原則;污染控制原則;低溫原則。公司可提供詳細的樣本準備和運輸指南。
5、保存和運輸
樣本用液氮速凍,-80度保存或者直接干冰寄送即可。
6、樣品標記
樣品標記清晰,盡量使用英文和數字組合,字符數在15個以內為好。同時按照公司的技術需求表填寫樣本詳細信息。
7、其他
客戶認真填寫公司的技術需求表,務必隨樣品一起郵寄,由于表格信息不全造成的損失由客戶自行承擔。
結果示例
部分分析結果示例
參考文獻
1) Transcriptome Analysis Reveals Downregulation of Urocortin Expression in the Hypothalamo-Neurohypophysial System of Spontaneously Hypertensive Rats.
2) Identification of Immune-Related Therapeutically Relevant Biomarkers in Breast Cancer and Breast Cancer Stem Cells by Transcriptome-Wide Analysis: A Clinical Prospective Study.
3) Iron-Deficiency Anemia Results in Transcriptional and Metabolic Remodeling in the Heart Toward a Glycolytic Phenotype.