服務簡介
全轉錄組是指特定物種、組織或細胞類型在某個時期或條件處理下，能轉錄出來的所有 RNA（轉錄本）的總和，包括 mRNA 和非編碼 RNA (ncRNA)。目前所說的全轉錄組測序，主要針對mRNA 和三種 ncRNA，即 lncRNA、circRNA 和 miRNA 進行測序分析。全轉錄組測序實驗的優勢在于，既可利用高通量測序技術全面快速得到已知基因（廣義上指mRNA、 lncRNA、 circRNA、 miRNA）的表達豐度變化；同時可以通過測定的序列信息精確地分析 mRNA 的 cSNP/InDel（即編碼序列的單核苷酸多態性/插入缺失）、可變剪接、基因融合等，以及不同類型 RNA 的序列及結構變異研究；而且通過增加測序數據量，有助于檢測低豐度轉錄本和發現新轉錄本；進而整合分析同一樣本中的多種類型 RNA，明確這些 RNA 之間的共表達和相互作用/調控關系。 全轉錄組測序項目需要同時構建兩個測序文庫，包括 rRNA 去除的鏈特異性文庫和小 RNA 文庫。
應用領域
生長發育機制研究
逆境脅迫機制研究
轉錄調控研究
功能基因發掘
技術路線
研磨稱量
RNA抽提
文庫構建
上機測序
數據解析
報告出具
技術優勢
高通量，多種類型 RNA同時檢測
Illumina Novaseq 6000測序平臺覆蓋更廣泛
專業的技術服務團隊
樣本要求
1、樣品類型
植物組織，細胞，微生物（細菌/真菌）和液體類；
2、生物學重復
建議3次及以上生物學重復；
3、樣品需求量
植物組織≥200mg、細胞≥107、微生物（細菌/真菌）≥200mg、液體類≥2.5ml，特殊情況請與公司聯系；
4、樣品準備
樣本準備基本原則有：代表性原則、迅速性原則、分裝備份原則、污染控制原則、低溫原則，公司可提供詳細的樣本準備和運輸指南；
5、保存和運輸
樣本用液氮速凍，-80度保存或者直接干冰寄送即可；
6、樣品標記要求
樣品標記清晰，盡量使用英文和數字組合，字符數在15個以內為好，同時按照公司的技術需求表填寫樣本詳細信息；
7、其他
客戶認真填寫公司的技術需求表，表格信息不全會對后期項目進行產生諸多影響，請填寫后務必隨樣品一起郵寄。
結果示例
部分分析結果
參考文獻
1) Whole-transcriptome sequencing reveals a vernalization-related ceRNA regulatory network in chinese cabbage (Brassica campestris L. ssp. Pekinensis.
2) Molecular memory of Flavescence dorée phytoplasma in recovering grapevines.
3) Whole-genome, transcriptome, and methylome analyses provide insights into the evolution of platycoside biosynthesis in Platycodon grandiflorus, a medicinal plant.