

全新升級!功能多糖核磁解析2.0版正式上線
多糖具有多種生物活性,而多糖的結(jié)構(gòu)是影響其生物活性的關(guān)鍵因素。近幾十年來多糖研究已經(jīng)取得極大進步,但是受多糖分離純化及其結(jié)構(gòu)復雜性的限制,其結(jié)構(gòu)分析一直是多糖研究中的難題,核磁作為研究結(jié)構(gòu)經(jīng)典的手段之一在多糖結(jié)構(gòu)解析中起到關(guān)鍵作用,通過一維1H NMR和13C NMR譜可得到其整體結(jié)構(gòu)信息,二維NMR譜則能給出相關(guān)碳氫連接方式方面的信息。
核磁共振(NMR)的原理主要是利用原子核在強磁場中發(fā)生能級分裂,吸收外來電磁輻射后發(fā)生核自旋能級的躍遷,即產(chǎn)生核磁共振。相比經(jīng)典的化學法,多糖核磁解析具有無破壞性,樣品可回收性的獨特優(yōu)勢。
三黍生物核磁解析2.0版本全新升級,從儀器平臺、圖譜掃描到分析內(nèi)容、圖片形式等做了一系列的增補與更新,全面提升檢測能力與數(shù)據(jù)質(zhì)量,以期為廣大科研用戶提供更多有價值的信息,助力科學研究。
01
多!分析內(nèi)容更豐富、形式更多樣
三黍生物在保留已有圖譜(1H、13C、COSY、NOESY、HSQC和HMBC)分析的基礎(chǔ)上,新增了近年來文獻中經(jīng)常出現(xiàn)、客戶反饋訴求較高的兩張核磁圖譜(DEPT135和TOCSY),基本涵蓋了目前常規(guī)多糖核磁解析所需的所有圖譜。同時調(diào)整優(yōu)化了解析等級,以期滿足不同客戶的解析需求。
1H NMR(一維氫譜)
一維氫譜主要解決多糖結(jié)構(gòu)中糖苷鍵的構(gòu)型問題。多糖在1H NMR中的信號集中于3~6 ppm。通常β-糖苷鍵構(gòu)型的異頭氫信號主要分布在δ 4.3~4.9 ppm,α-糖苷鍵構(gòu)型的異頭氫信號主要分布在δ 4.9~5.8 ppm。
13C NMR(一維碳譜)
與1H NMR相比,多糖在13C NMR中的化學位移信號分布較寬。譜線重疊少,可以提供糖殘基信息(多糖在13C NMR中的異頭碳信號集中于95-110ppm), 確定糖鏈的連接位置和某些特定基團 (如 δ 170~176 范 圍 的 己 糖 醛 酸 的 羧 基 或 乙 酰 氨 基 信號)。
圖1 a. 1H NMR—無標峰
圖1 b. 1H NMR—高級
圖1 c. 1H NMR—超級
圖2 a. 13C NMR—無標峰
圖2 b. 13C NMR—高級
圖2 c. 13C NMR—超級
COSY(氫-氫相關(guān)譜)
氫-氫相關(guān)譜(COSY)是最常用的同核位移相關(guān)譜。一般反映的是鄰碳氫的偶合關(guān)系,從而可知同一自旋體系里質(zhì)子之間的偶合關(guān)系,是歸屬譜線、推導結(jié)構(gòu)強有力的工具。同一糖殘基的1H信號將在對角線上相交,交點稱對角峰(diagonal peak)。圖上對角線兩側(cè)呈對稱分布的兩個點叫相關(guān)峰 (cross peak,或correlation peak)。相互偶合的兩個/組1H信號將在相關(guān)峰上相交,主要解析的是相鄰或相間質(zhì)子氫相關(guān)信號。
NOESY(氫-氫相關(guān)譜)
NOESY屬NOE類的二維核磁共振譜。NOE主要用來確定兩個質(zhì)子在分子立體空間結(jié)構(gòu)中是否距離相近,若存在NOE則表示兩者接近,NOE值越大,則兩者在空間的距離就越近。NOE對確定有機化合物的結(jié)構(gòu)、構(gòu)型和構(gòu)象具有重要作用。
圖3 a. COSY—無標峰
圖3 b. COSY—高級圖
圖3c. COSY—超級
圖4 a. NOESY—無標峰
圖4 b. NOESY—高級
圖4 c. NOESY—超級
HSQC(碳-氫相關(guān)譜)
HSQC譜是C-H 異核單量子相關(guān)譜。HSQC把1H 核和與其直接相連的13C核關(guān)聯(lián)起來,所提供的信息及譜圖與13C-1H COSY譜相同。它同HMBC一樣也是通過測定靈敏度高的1H核來檢測13C-1H之間的遠程偶合相關(guān)信息,靈敏度比傳統(tǒng)的遠程偶合13C-1H COSY高得多。
HMBC(碳-氫相關(guān)譜)
HMBC譜是C-H 異核多鍵相關(guān)譜。HMBC可高靈敏地檢測碳與氫的遠程偶合信號,即相鄰兩個糖殘基之間的C與H的偶合。通過異頭氫(碳)與另一糖殘基相連的碳(氫)偶合,推斷單糖殘基間的連接片段和順序。
圖5 a. HSQC—無標峰
圖5 b. HSQC—高級
圖5 c. HSQC—超級
圖6 a. HMBC—無標峰
圖6 b. HMBC—高級
圖6 c. HMBC—超級
DEPT135
DEPT譜又稱為無畸變極化轉(zhuǎn)移技術(shù),在NMR中用來區(qū)分伯仲叔季碳的一種譜圖。DEPT-135譜圖的甲基,次甲基的峰向上(即信號為正),亞甲基為倒峰(即信號為負),季碳在DEPT譜圖中沒有信號,通過和全譜(13C NMR)比較可以明確季碳和亞甲基信號,進一步驗證13C NMR解析數(shù)據(jù)的準確性。
圖7 a. DEPT135—無標峰
圖7 b. DEPT135—高級
圖7 c. DEPT135—超級
TOCSY
總相關(guān)譜TOCSY是一個典型的同核二維譜圖。該實驗即是利用自旋鎖定過程中的等頻混合條件,使完整耦合自旋鏈上的所有氫原子核間產(chǎn)生交叉峰,從而進行結(jié)構(gòu)鑒定,非常適合解析復雜偶合體系。結(jié)合COSY共同分析,對復雜的重疊譜圖進行解析,從端基質(zhì)子出發(fā),逐個解析出與其耦合的質(zhì)子,進一步確認COSY圖譜分析的準確性。
圖8 a. DEPT135—不含標峰
圖8 b. DEPT135—高級
圖8 c. DEPT135—超級
02
全!儀器平臺更全面
核磁共振波譜儀是研究原子核在強磁場中對射頻輻射吸收的儀器,是對各種有機和無機物的成分、結(jié)構(gòu)進行定性定量分析的最強有力的工具之一。可應用于有機化學、生物化學、藥物化學等領(lǐng)域的結(jié)構(gòu)分析和性能研究,也可用于液體、可溶性有機物、聚合物的分子結(jié)構(gòu)和分子之間相互作用研究。
500M核磁共振波譜儀配備了5mm BBFO高分辨液體探頭,具有高精度變溫實驗功能,具有獲得最佳一維、二維及多維譜圖的數(shù)據(jù)處理速度與存貯能力,主要用于有機化合物、天然產(chǎn)物等樣品的結(jié)構(gòu)鑒定等研究。新增的600M核磁共振波譜儀屬于高場譜儀,配備超低溫探頭,具有高分辨率和高靈敏度的優(yōu)勢,可以實現(xiàn)對微量樣品的高效檢測,為多糖結(jié)構(gòu)確證提供更為準確的分析。
圖9原有Bruker 500MHz核磁共振波譜儀 (左圖)
新增Bruker 600MHz核磁共振波譜儀(右圖)
02
經(jīng)典案例分享
案例一
題目:Structural characterization of a Chlorella heteropolysaccharide by analyzing its depolymerized product and finding an inducer of human dendritic cell maturation
期刊:Carbohydrate Polymers
IF:11.2
時間:2024
技術(shù)方法:分子量分析、單糖組成、鍵合形式分析、自由基解聚、NMR、流式細胞術(shù)、ELISA、MLR
文章略讀:
小球藻多糖因其產(chǎn)量高、具有顯著的免疫調(diào)節(jié)活性而受到人們的廣泛關(guān)注,該研究從小球藻中分離得到一個主要多糖組分CPP-3a,并通過分析自由基解聚法制備的低分子量產(chǎn)物研究了其詳細結(jié)構(gòu)。
結(jié)果表明,CPP-3a的分子量為 195. 2kDa,主要由阿拉伯糖、鼠李糖、葡萄糖、半乳糖、甘露糖等多種糖殘基構(gòu)成,根據(jù)DEPT-135譜6對各糖殘基的C-6位置初步確定,結(jié)合COSY、TOCSY和ROESY譜歸屬了每個殘基內(nèi)自旋耦合體系中C-2到C-5/6位的質(zhì)子信號,并在HSQC和HMBC譜中發(fā)現(xiàn)了它們之間的關(guān)聯(lián)碳信號。綜合分析其解聚產(chǎn)物的核磁共振譜圖發(fā)現(xiàn)其具有復雜的高度支化結(jié)構(gòu)。生物學實驗表明,CPP-3a 具有促進人DC(dendritic cell,樹突細胞)成熟和T細胞刺激作用,可能是一種新型 DC 成熟誘導劑,在 DC 免疫療法中具有潛在的開發(fā)價值。
圖10 技術(shù)路線圖一
圖11. (A) 13C, (B)DEPT-135, (C) COSY, (D)TOCSY, (E)ROESY, (F)HSQC, and (G)HMBC
參考文獻:Yuan Q X, Liang R Y, Lv K L, et al. Structural characterization of a Chlorella heteropolysaccharide by analyzing its depolymerized product and finding an inducer of human dendritic cell maturation. Carbohydrate Polymers. 2024 Jun 1; 333:122000. DOI: 10.1016/j.carbpol.2024.122000 .
案例二
題目:Structural characterization, molecular dynamic simulation, and conformational visualization of a water-soluble glucan with high molecular weight from Gastrodia elata Blume
期刊:International Journal of Biological Macromolecules
IF:8.2
時間:2024
技術(shù)方法:分子量分析、單糖組成、鍵合形式分析、NMR、FT-IR、AFM、分子動力學模擬、
文章略讀:
天麻是一種藥用和食用植物。該研究首次得到了高相對分子質(zhì)量為2.7×106 Da的水溶性多糖GEP2-6,其純度可達99.2%。通過化學成分和譜圖分析,得出GEP2-6是僅由α-(1→4)和α-(1→6)糖苷鍵連接的葡聚糖。利用NMR對酶解后的樣品中各糖殘基的化學位移進行歸屬,通過1H、13C和對應的DEPT 135 NMR譜圖,可以很容易地區(qū)分出異頭區(qū)以及6號位仲碳的典型信號,結(jié)合二維圖譜(HSQC、HMBC、COSY和TOCSY)對相關(guān)碳氫化學位移進行歸屬。用葡聚糖數(shù)據(jù)庫和空間檢測軟件進一步模擬了重復單元的糖苷連接模式,原子力顯微鏡證實了球形柔性鏈和多孔的穩(wěn)定構(gòu)象。此外,GEP2-6還能有效清除DPPH和羥基自由基,是一種很有前景的天然抗氧化劑。
圖12 技術(shù)路線圖二
圖13 (A) 1H, (B) 13C and (C) DEPT 135
圖14 (A) HSQC, (B) HMBC,(C) 1H-1H COSY,(D) TOCSY
參考文獻:Chen J Q, Miao W, Liu Y, et al. Structural characterization, molecular dynamic simulation, an-d conformational visualization of a water-soluble glucan with high molecular weight from Gastrodia elata Blume. International Journal of Biological Macromolecules. 2024 Apr, 263: 130207. DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2024.130207.
糖類化合物由于分子量大,其結(jié)構(gòu)分析一直以來都是工作難點。新增的兩張圖譜(DEPT135、TOCSY)為多糖分析提供了更多的信息,進一步驗證解析結(jié)果的準確性,使研究內(nèi)容更加豐富可信。
排版:野凌
審核:三黍生物企宣部